医学院前身为创办于1950年的扬州卫生学校和创办于1929年的上海私立惠生高级助产职业学校（该校1952年迁至扬州转为公办与扬州卫校合并），2003年开办全日制普通专科相关医学教育，已有90余年办学历史。目前开办护理、助产、医学检验技术、药学、中药学、康复治疗技术等医学相关专业，在校生1703名。医学院现有教职工77名，专任教师68名，其中教授4名，副教授25名，博士12名。江苏省“333高层次人才培养对象”2名，江苏省青蓝工程中青年学术带头人2名，江苏省青蓝工程青年骨干教师5名，江苏省五一创新能手2名，江苏省科技副总8名，扬州市英才培养对象2名，师资力量雄厚，配备合理。

医学院一贯重视学生职业能力和职业素质的培养，校企深度合作在校内外建立了一大批实践教学场所和虚拟仿真实训教学基地。基础医学实训中心建有生命科学馆、人体解剖学实训区、形态学实训区和机能学实训区；护理实训中心建有模拟病房、基础护理技术实训区、临床护理技术实训区、虚拟仿真实训区；医学检验实训中心建有生物学检验实验实训区、形态学检验实验实训区；药学实训中心建有药品生产炮制实训区、中药标本馆、模拟药房实验实训室；康复实训中心建有运动治疗实训室、作业治疗实训室、言语治疗实训室、物理因子治疗实训室、心理咨询实训室、康复工程实训室等实训室。在校外建立了以徐州医科大学附属医院、东部战区总医院、中国人民解放军联勤保障部队第903医院、苏北人民医院、盐城市第一人民医院、扬州大学附属医院、泰州市人民医院、江苏大学附属医院、江南大学附属医院、南通市中医院、高邮中医医院、扬州市颐和康复医院等医疗卫生机构及扬州联环药业股份有限公司、国药控股扬州有限公司等医药生产和销售企业为主的稳定的校外实训基地50余家，为学生职业能力培养、实现充分高质量就业提供了有力的保障。

医学院始终立足服务区域大健康产业需求，以“培养高素质创新型技术技能人才”为办学宗旨，坚持“育人为本，德育为先，创新引领，协调发展”为指导思想，深化产教融合、强化“五金”建设，政校行企协同推进人才培养模式改革，人才培养质量不断提升。近年来，先后获批中央财政支持提升专业服务产业能力建设专业、中央财政支持实训基地、教育部创新发展行动计划骨干专业、江苏省财政支持实训基地、江苏省科普教育基地、江苏省职业教育示范性虚拟仿真实训基地、江苏省高水平专业群（护理专业群），获评全国优秀教材二等奖、立项国家级“十四五”规划教材1部，1名学生获首届全国大学生职业规划大赛国赛银奖。